秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

李耀武; 周有骏; 朱驹; 郑灿辉; 陈军; 唐辉; 栗亚男

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秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

李耀武, 周有骏, 朱驹, 郑灿辉, 陈军, 唐辉, 栗亚男

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李耀武, 周有骏, 朱驹, 郑灿辉, 陈军, 唐辉, 栗亚男. 秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究[J]. 药学实践与服务, 2007, (6): 372-375.

引用本文:

李耀武, 周有骏, 朱驹, 郑灿辉, 陈军, 唐辉, 栗亚男. 秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究[J]. 药学实践与服务, 2007, (6): 372-375.

LI Yao-wu, ZHOU You-jun, ZHU Ju, ZHENG Can-hui, CHEN Jun, TANG Hui, LI Ya-nan. Study on the structural features of colchicine-site inhibitors[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2007, (6): 372-375.

Citation:

LI Yao-wu, ZHOU You-jun, ZHU Ju, ZHENG Can-hui, CHEN Jun, TANG Hui, LI Ya-nan. Study on the structural features of colchicine-site inhibitors[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2007, (6): 372-375.

秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

第二军医大学药学院药物化学教研室,上海200433

Study on the structural features of colchicine-site inhibitors

Department of Medicinal Chemistry,Pharmacy School,Second Military Medical University,Shanghai 200433,China

摘要: 目的:寻找秋水仙碱结合位点抑制剂的结构特征。方法:将对接得到的8种不同结构抑制剂的结合构象进行叠合匹配,并结合已有的SAR结论来探讨。结果:整个结构由两个疏水基团A、B以及之间的桥链部分组成,但是在空间上A和B必须处于桥链的同侧。A基团的体积以及氢键受体基团的存在对活性有较大影响,B需为平面环且宜连接极性基团以增强结合,而桥链部分可以为1-4个长度的原子但以sp²杂化类型最佳。结论:研究得出的结构特征为设计新的秋水仙碱位点抑制剂提供了直观、简便的参考。
- 微管 /
- 秋水仙碱 /
- 药效团 /
- 分子对接
Abstract: Objective :To determine the structural features of a set of diverse colchicines-site inhibitors. Methods :The features were revealed by matching the binding conformations generated from docking studies of eight inhibitors,and combined with the available SAR results. Results : The feature is represented as two hydrophobic groups（A and B） and a bridge linked between them,but A and B should be in the same side of the bridge.The volume size and the existence of hydrogen-bond acceptor of group A may have some influence on binding.Group B should be a hydrophobic planar ring,and polar functional group is advantageous.The bridge part could accept 1-4 atoms,but the Sp² hybrid is welcome. Conclusion :this result may provide useful insights for the design of novel Colchicine-site inhibitors.
- microtubule /
- colchicine /
- pharmacophor /
- molecular docking

[1]	张广雨, 杜晶, 刘梦珍, 朱丹妮, 闫慧, 刘冲. 新斯的明与山莨菪碱联合应用对肺型氧中毒的保护作用及其机制的研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(10): 433-438, 444. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202310049
[2]	晁亮, 王辉, 沈淑琦, 游飘雪, 冀凯宏, 洪战英. 基于UHPLC-Q/TOF-MS代谢组学策略的葛根-知母药对防治阿尔茨海默病的药效与作用机制研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(): 1-11. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202409035
[3]	杨嘉宁, 赵一颖, 肖伟. 七味脂肝方对非酒精性脂肪性肝炎动物模型的药效学评价 . 药学实践与服务, 2024, 42(9): 389-398. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202404096
[4]	宋泽成, 马闪闪, 胡巧灵, 仲华, 王彦. 小檗碱与氟康唑合用抗白念珠菌耐受菌的研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(): 1-5. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202409047
[5]	杨贺英, 罗彩萍, 彭婷, 梁文仪, 沈颂章, 苏娟. 花椒生物碱富集纯化工艺优化及其成分分析 . 药学实践与服务, 2024, 42(): 1-7. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202404066
[6]	白学鑫, 陈玉平, 盛春泉, 武善超. 具核梭杆菌小分子抑制剂的筛选及其抗结直肠癌活性研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(12): 503-507. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202405009
[7]	景凯, 杨慈荣, 张圳, 臧艺蓓, 刘霞. 黄芪甲苷衍生物治疗慢性心力衰竭小鼠的药效评价及作用机制研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(5): 190-197. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202310004
[8]	刘汝雄, 杨万镇, 涂杰, 盛春泉. 铁死亡调控蛋白GPX4的小分子抑制剂研究进展 . 药学实践与服务, 2024, 42(9): 375-378. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202312075
[9]	何静, 安晔, 张朝绅. 复方黑参滴丸与复方黑参丸药效学实验比较研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(): 1-5. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202404009
[10]	陈莹, 许子华, 胡北, 崔亚玲, 高欢, 吴琼. 通便灵胶囊治疗便秘的药效与机制研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(): 1-7. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202404008
[11]	陈金涛, 乔子婴, 马明华, 张若曦, 王振伟, 年华. 基于网络药理学和分子对接技术研究金芪清疏颗粒治疗社区获得性肺炎的潜在机制 . 药学实践与服务, 2024, 42(11): 471-478. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202312014
[12]	张成中, 朱雪艳, 卜其涛, 王宏瑞, 黄宝康. 基于网络药理学与分子对接预测鸡骨草特征图谱研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(8): 350-358. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202303048
[13]	陈静, 何瑞华, 翁月, 徐熠, 刘静, 黄瑾. 基于网络药理学和分子对接技术探究定清片活性成分治疗白血病的作用机制 . 药学实践与服务, 2024, 42(11): 479-486. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202401073

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秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

第二军医大学药学院药物化学教研室,上海200433

收稿日期: 2007-09-07

关键词:

微管 /

秋水仙碱 /

药效团 /

分子对接

摘要: 目的:寻找秋水仙碱结合位点抑制剂的结构特征。方法:将对接得到的8种不同结构抑制剂的结合构象进行叠合匹配,并结合已有的SAR结论来探讨。结果:整个结构由两个疏水基团A、B以及之间的桥链部分组成,但是在空间上A和B必须处于桥链的同侧。A基团的体积以及氢键受体基团的存在对活性有较大影响,B需为平面环且宜连接极性基团以增强结合,而桥链部分可以为1-4个长度的原子但以sp²杂化类型最佳。结论:研究得出的结构特征为设计新的秋水仙碱位点抑制剂提供了直观、简便的参考。