红花cDNA-AFLP限制性内切酶的选择及银染体系的建立

杨娟; 郭美丽

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红花cDNA-AFLP限制性内切酶的选择及银染体系的建立

杨娟, 郭美丽

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杨娟, 郭美丽. 红花cDNA-AFLP限制性内切酶的选择及银染体系的建立[J]. 药学实践与服务, 2009, 27(6): 421-425.

引用本文:

杨娟, 郭美丽. 红花cDNA-AFLP限制性内切酶的选择及银染体系的建立[J]. 药学实践与服务, 2009, 27(6): 421-425.

YANG Juan, GUO Mei-Li. Choice of restriction endonuclease and establishment of silver-staining method in cDNA-AFLP System for Carthamus tinctorius[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2009, 27(6): 421-425.

Citation:

YANG Juan, GUO Mei-Li. Choice of restriction endonuclease and establishment of silver-staining method in cDNA-AFLP System for Carthamus tinctorius[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2009, 27(6): 421-425.

红花cDNA-AFLP限制性内切酶的选择及银染体系的建立

杨娟,
郭美丽

第二军医大学药学院生药学教研室,上海200433

基金项目: 国家自然科学基金资助项目(30772734)

Choice of restriction endonuclease and establishment of silver-staining method in cDNA-AFLP System for Carthamus tinctorius

Department of Pharmacognosy, School of Pharmacy, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China

摘要: 目的:建立适于红花cDNA-AFLP分析酶切组合及银染技术体系,为进一步进行红花重要性状相关基因研究奠定基础。方法:对PstI/MseI和MseI/EcoRI两种限制性内切酶组合酶切效率进行比较,并探讨测序板处理中亲和硅烷和剥离硅烷的用量、测序胶中TEMED的用量、预电泳、温度因素、显色液的配置等银染过程中较关键的几个因素。结果:选用PstI/MseI限制性内切酶组合酶切效率较高,测序板应彻底清洁,TEMED量应适中,应进行30 min预电泳,整个铺板电泳过程保持温度恒定,选用4℃冷藏的碳酸钠做显色液效果好,综合以上几方面能显著提高胶图的质量。结论:本研究建立了适于红花的cDNA-AFLP银染体系,PstI/MseI较MseI/EcoRI酶切组合具有更高的多态性率,能更全面地揭示红花研究材料间更为丰富的遗传变异性;银染过程中成功克服了以往试验中常见的撕胶、背景太深、条纹不清晰等问题。
- 红花 /
- cDNA-AFLP /
- 银染体系 /
- 限制性内切酶
Abstract: Objective :To establishing an appropriate combination of restriction endonuclease and silver-staining system for cDNA-AFLP analysis in Carthamus tinctorius L,. Methods :The efficiency of combination of PstI/MseI and MseI/EcoRI is compared.Several key factors in silver-staining including the affiliation and dissection dosage in sequencing plate processing,TEMED dosage in gel,pre-electrophoresis,temperature factor,staining liquid configuration etc are researched and discussed. Results :Enzyme efficiency of PstI/MseI is higher than MseI/EcoRI.Sequencing plate should be cleaned thoroughly.TEMED volume should be moderate.30mins pre-electrophoresis should be carried out.Temperature should be constant through the whole electrophoresis process. Conclusion :This research has found a high effective restriction endonuclease combination can further discover the genetic background of safflower and has established an appropriate silver-staining system which has overcome several problems in staining process.
- Cathamus tinctorius L. /
- cDNA-AFLP /
- silver-staining system /
- restriction endonuclease

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红花cDNA-AFLP限制性内切酶的选择及银染体系的建立

杨娟,
郭美丽

第二军医大学药学院生药学教研室,上海200433

基金项目: 国家自然科学基金资助项目(30772734)

收稿日期: 2009-06-18

关键词:

红花 /

cDNA-AFLP /

银染体系 /

限制性内切酶

摘要: 目的:建立适于红花cDNA-AFLP分析酶切组合及银染技术体系,为进一步进行红花重要性状相关基因研究奠定基础。方法:对PstI/MseI和MseI/EcoRI两种限制性内切酶组合酶切效率进行比较,并探讨测序板处理中亲和硅烷和剥离硅烷的用量、测序胶中TEMED的用量、预电泳、温度因素、显色液的配置等银染过程中较关键的几个因素。结果:选用PstI/MseI限制性内切酶组合酶切效率较高,测序板应彻底清洁,TEMED量应适中,应进行30 min预电泳,整个铺板电泳过程保持温度恒定,选用4℃冷藏的碳酸钠做显色液效果好,综合以上几方面能显著提高胶图的质量。结论:本研究建立了适于红花的cDNA-AFLP银染体系,PstI/MseI较MseI/EcoRI酶切组合具有更高的多态性率,能更全面地揭示红花研究材料间更为丰富的遗传变异性;银染过程中成功克服了以往试验中常见的撕胶、背景太深、条纹不清晰等问题。