秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

李耀武; 周有骏; 朱驹; 郑灿辉; 陈军; 唐辉; 栗亚男

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秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

李耀武, 周有骏, 朱驹, 郑灿辉, 陈军, 唐辉, 栗亚男

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李耀武, 周有骏, 朱驹, 郑灿辉, 陈军, 唐辉, 栗亚男. 秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究[J]. 药学实践与服务, 2007, (6): 372-375.

引用本文:

李耀武, 周有骏, 朱驹, 郑灿辉, 陈军, 唐辉, 栗亚男. 秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究[J]. 药学实践与服务, 2007, (6): 372-375.

LI Yao-wu, ZHOU You-jun, ZHU Ju, ZHENG Can-hui, CHEN Jun, TANG Hui, LI Ya-nan. Study on the structural features of colchicine-site inhibitors[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2007, (6): 372-375.

Citation:

LI Yao-wu, ZHOU You-jun, ZHU Ju, ZHENG Can-hui, CHEN Jun, TANG Hui, LI Ya-nan. Study on the structural features of colchicine-site inhibitors[J]. Journal of Pharmaceutical Practice and Service, 2007, (6): 372-375.

秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

第二军医大学药学院药物化学教研室,上海200433

Study on the structural features of colchicine-site inhibitors

Department of Medicinal Chemistry,Pharmacy School,Second Military Medical University,Shanghai 200433,China

摘要: 目的:寻找秋水仙碱结合位点抑制剂的结构特征。方法:将对接得到的8种不同结构抑制剂的结合构象进行叠合匹配,并结合已有的SAR结论来探讨。结果:整个结构由两个疏水基团A、B以及之间的桥链部分组成,但是在空间上A和B必须处于桥链的同侧。A基团的体积以及氢键受体基团的存在对活性有较大影响,B需为平面环且宜连接极性基团以增强结合,而桥链部分可以为1-4个长度的原子但以sp²杂化类型最佳。结论:研究得出的结构特征为设计新的秋水仙碱位点抑制剂提供了直观、简便的参考。
- 微管 /
- 秋水仙碱 /
- 药效团 /
- 分子对接
Abstract: Objective :To determine the structural features of a set of diverse colchicines-site inhibitors. Methods :The features were revealed by matching the binding conformations generated from docking studies of eight inhibitors,and combined with the available SAR results. Results : The feature is represented as two hydrophobic groups（A and B） and a bridge linked between them,but A and B should be in the same side of the bridge.The volume size and the existence of hydrogen-bond acceptor of group A may have some influence on binding.Group B should be a hydrophobic planar ring,and polar functional group is advantageous.The bridge part could accept 1-4 atoms,but the Sp² hybrid is welcome. Conclusion :this result may provide useful insights for the design of novel Colchicine-site inhibitors.
- microtubule /
- colchicine /
- pharmacophor /
- molecular docking

[1]	潘宇炯, 何志高, 陈石秀, 周桂, 周昕, 郁超. 基于网络药理学和分子对接技术探讨杞贞滋阴合剂治疗性腺功能减退症的作用机制 . 药学实践与服务, 2024, 42(1): 24-31. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202208111
[2]	陈金涛, 乔子婴, 章祎俊, 许玲, 郑月娟, 何宗阳, 刘良善, 马明华, 张若曦, 王振伟, 年华. 基于网络药理学、分子对接研究金芪清疏颗粒治疗CAP的潜在机制 . 药学实践与服务, 2024, 42(): 1-9. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202312014
[3]	张成中, 朱雪艳, 卜其涛, 王宏瑞, 黄宝康. 基于网络药理学与分子对接预测鸡骨草特征图谱研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(): 1-9. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202303048
[4]	柯刚, 董清科, 肖世容, 龚茜, 李荣, 汪代杰. 基于网络药理学探讨参苓白术散治疗肿瘤恶病质的作用机制研究 . 药学实践与服务, 2024, 42(3): 1-9. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202208115
[5]	董雨龙, 娄成, 陈熙昀, 魏炜, 陶晨洁, 韩琴, 袁振刚. 基于网络药理学探讨通关藤抗肝细胞癌的作用机制 . 药学实践与服务, 2023, 41(10): 600-609. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202212049
[6]	余伟莉, 韦伊芳, 叶姿劭, 刘爱芬, 王成牛, 张磊. 基于网络药理学和分子对接技术探究青蒿素对多囊卵巢综合征的潜在治疗机制 . 药学实践与服务, 2023, 41(12): 714-721. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202209051
[7]	王吉荣, 史小飞, 种育晖, 贾令茹, 万雪莹, 李睿旻. 基于网络药理学与分子对接技术对白术-半夏-茯苓配伍治疗胰腺癌作用机制的研究 . 药学实践与服务, 2023, 41(10): 616-624. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202306022
[8]	张敏, 汪晓河, 周阳云, 石美智, 韩忻云, 韩向晖, 陈君君. 基于网络药理学和分子对接的苦参抗乳腺癌潜在机制研究 . 药学实践与服务, 2023, 41(12): 722-732. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202302001
[9]	孟祥庆, 李丽华, 王宏瑞, 贾丹, 贾敏. 基于网络药理学和反向分子对接的西红花抗肿瘤作用机制研究 . 药学实践与服务, 2023, 41(3): 160-167, 196. doi: 10.12206/j.issn.2097-2024.202206066
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[11]	蔡孟成, 刘益群, 俞超芹, 金永生. 基于网络药理学与分子对接技术对清开灵干预病毒性感冒的作用机制研究 . 药学实践与服务, 2021, 39(3): 193-202. doi: 10.12206/j.issn.1006-0111.202005077
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秋水仙碱位点抑制剂的结构特征研究

第二军医大学药学院药物化学教研室,上海200433

收稿日期: 2007-09-07

关键词:

微管 /

秋水仙碱 /

药效团 /

分子对接

摘要: 目的:寻找秋水仙碱结合位点抑制剂的结构特征。方法:将对接得到的8种不同结构抑制剂的结合构象进行叠合匹配,并结合已有的SAR结论来探讨。结果:整个结构由两个疏水基团A、B以及之间的桥链部分组成,但是在空间上A和B必须处于桥链的同侧。A基团的体积以及氢键受体基团的存在对活性有较大影响,B需为平面环且宜连接极性基团以增强结合,而桥链部分可以为1-4个长度的原子但以sp²杂化类型最佳。结论:研究得出的结构特征为设计新的秋水仙碱位点抑制剂提供了直观、简便的参考。